Wzrost ciśnienia tętniczego obserwowany w czasie epizodów bezdechu koreluje z stopniem zmniejszenia utlenowania krwi. Częste powtarzające się bezdechy prowadzą do zmian adaptacyjnych w układzie autonomicznym, co wyraża się jego nadmiernym pobudzeniem, również w ciągu dnia. Związek zespołu bezdechu w czasie snu ze wzrostem ciśnienia jest „dawko-zależny", a przy tym niezależny od wieku, spożywania alkoholu, palenia papierosów i wskaźnika masy ciała. Powtarzające się niedotlenienia, poza aktywacją układu współczulnego, wiążą się z pobudzeniem układu renina-angiotensyna-aldosteron, dysfunkcją śródbłonka (zmniejszona aktywność syntazy tlenku azotu) oraz hiperinsulinemią, co stanowi o przejściu nadciśnienia w fazę utrwaloną.
Należy podkreślić, iż zespół bezdechu w czasie snu to jedna z najważniejszych przyczyn nadciśnienia opornego na leczenie. W każdym przypadku stwierdzonej oporności na leczenie, zwłaszcza u osób z nadmierną masą ciała, należy wykluczyć opisywany zespół.
Wyniki badań 3 metaanaliz wskazują, iż zastosowanie aparatów CPAP (Continous Positive Airway Pressure), podstawowej metody leczenia zespołu bezdechu w czasie snu, zmniejsza średnie ciśnienie dobowe o około 2 mm Hg.